Theo đó, vào khoảng 21 giờ 20 ngày 15/3/2021, tại Km1328 + 600 là đường ngang dân sinh trong ga Cây Cầy (Khánh Hòa), tàu SE21 do đầu máy D19E - 952 kéo đã tông vào đuôi 1 xe container.
Vụ va chạm khiến đầu máy bị trật bánh, 4 toa xe bị hư hỏng nặng. Xe container bị hư hỏng nặng. Lúc này trên tàu có 170 hành khách. Toàn bộ hành khách và ban lái tàu đều an toàn.
Ngay sau sự cố xảy ra, ngành đường sắt đã tổ chức tàu cứu viện từ ga Nha Trang. Đến sáng nay, 16/3, tuyến đường sắt Bắc- Nam đã thông trở lại với tốc độ chậm, khoảng 15km/h.
Vụ tai nạn khiến các đoàn tàu khác bị ảnh hưởng chậm giờ: Tàu SE3 xuất phát ngày 14/3, tàu SE6 xuất phát ngày 15/3.