Thời gian thanh thải dự kiến kéo dài 1 tháng, từ 20/4 - 20/5/2021. Để phục vụ thanh thải trụ cầu, Chi cục tổ chức hạn chế giao thông thủy qua cầu Đuống từ 7 giờ - 19 giờ hàng ngày trong thời gian trên.
Tùy tình hình thi công thực tế, giao thông thủy qua cầu Đuống có thể hạn chế ở mức độ cấm hẳn phương tiện qua lại hoặc phương tiện được lưu thông hạn chế, một chiều. Tại khu vực hạn chế giao thông có bố trí báo hiệu và hai chốt trực khống chế, hướng dẫn phương tiện ở thượng và hạ lưu cầu Đuống.
Theo đơn vị quản lý tuyến đường thủy sông Đuống, từ cuối năm 2020, tại khoang thông thuyền cầu Đuống xuất hiện vật chướng ngại là trụ cầu Đuống cũ nằm gần giữa khoang thông thuyền, cách mép trụ cầu bên phải (phía quận Long Biên) 30,5m.
Khi mực nước tại cầu xuống dưới 0,5m độ sâu luồng tại trụ cầu cũ thấp hơn 3m, gây nguy hiểm cho phương tiện thủy qua lại. Vì vậy, cần được thanh thải để đảm bảo cho các phương tiện thủy lưu thông qua gầm cầu thuận lợi, an toàn.
Trong thời gian hạn chế giao thông để phục vụ thi công, các phương tiện thủy khi đến khu vực cầu Đuống phải tuyệt đối tuân theo hướng dẫn của lực lượng điều tiết, khống chế giao thông để đảm bảo ATGT.